《Origins and genetic legacy of prehistoric dogs》这是一篇2020年发表在科学杂志上的研究狗的起源和分化的论文，很多朋友对它感兴趣，但是苦于不了解其中的原理，所以我查阅了不少资料，也专门向懂行的朋友进行了询问，希望能够帮助到大家。

这篇文章主要研究了欧洲和西伯利亚、中东等地的古犬DNA以及探究了狗和人类之间扩散的相关性，虽然没有给出狗起源的最终结果，但是根据这些考古学证据，我们依然可以得到很多有用的信息，刚好很多朋友对这篇论文感兴趣，但是中文网上关于这篇论文的介绍却是十分的简要，于是我萌发了这样一个想法：是否可以根据论文上提供的信息更详细的介绍下这篇论文呢？这个念头萦绕着我，于是我查了一些资料，也问了些懂行的朋友，于是乎，就这样开始写了起来。

(资料图片)

本篇文章是结合古人类基因的结果共同分析狗的迁徙演化路线的，狗作为第一种被人类驯化的动物，迁徙与扩散不可避免的受到人类活动的干预，狗的迁徙路线一定是伴随着人类的活动进行的，但人类的活动并不是一定必然导致狗的迁徙。想看懂这篇论文的结论，就不得不补充相关的人类考古背景，本文的古DNA数据采样地主要为中东、欧洲和西伯利亚，反应的是欧亚大陆西部的情况，因此可以结合其他论文关于亚洲东部的研究对论文进行补充说明。

一.所有古代和现代欧洲犬与东方犬祖先的亲缘关系都高于古代中东犬，东方犬中，欧洲犬相较于东亚南部犬更接近西伯利亚犬和古代美洲犬。

论文中的这张PCA主成分分析图，其中可以看到在整个欧洲犬样本中，最接近东方犬类（西伯利亚/东亚/南太平洋）的是一个位于欧洲东北角1.09万年前的样本Karelia 10.9k，最远离东方犬的是6.5千年前希腊的样本Greece 6.5k，古代欧洲犬大体上呈现着越北越接近东方犬的态势，这可能预示着欧洲犬的东方祖源是从欧亚大陆的北端进入的。从线粒体上看，Karelia的类型为A1a，根据Ancient DNA Evidence from China Reveals the Expansion of Pacific Dogs论文的推算，整个A线粒体的最近共组时间（TMRCA）距今约1.92万年，诞生于末次盛冰期时

期，其中在东亚/西伯利亚古代及现代家犬及南太平洋犬中发现的A1b与A1a在约1万6千年前分化，也就是说欧洲犬中的常见的A1a在某处与A1b及A3分化后只用了最晚5千年的时间就到达了欧洲北部地区，如果考虑到欧洲还有发现更早的线粒体A类型犬科动物（距今1.4万年德国Bonn-Oberkassel遗址出土的类狗遗骸，详细见论文：A new look at an old dog: Bonn-Oberkassel reconsidered和1.45万年瑞士Kesslerloch_cave出土的类狼遗骸），很有可能线粒体A的分化地是一个离欧洲和北美不算特别遥远的地方。在末次盛冰期（LGM）时，欧洲北部地区被巨大冰川覆盖，陆生哺乳动物遭到彻底清空，其中也包括欧洲原有的犬科动物，

Karelia的祖先到达欧洲东北部时，面对的是一片未开发的处女地，因此还没有像之后的欧洲北部犬那样更加偏离东方犬类，但是这个局面并没有维持多久，到新石器时代农业兴起后，整个欧洲犬的遗传结构发生了一次大的变化。

二、新石器时代中东农人向欧洲扩张同时伴随着中东狗向欧洲扩张。

东地中海（以色列/黎巴嫩/叙利亚）地区在古代又称之为黎凡特，近东犬要比欧洲犬在遗传上更加远离东方犬种，按照论文Grey wolf genomic history reveals a dual ancestry of dogs的看法，黎凡特犬混有中东灰狼的成分或者说狗有双重起源。这个成分可能在中东/西亚/中亚的某个地区混入，随后伴随着贸易/人口迁徙进入欧洲和非洲。双重起源假说或者中东灰狼混入说或许可以解释中东犬较欧洲犬与东方犬差异更大的原因。作者推测这个变化和农业在欧洲的扩散有关，作者对比了瑞典同时期的农业遗址和狩猎采集遗址中的古犬DNA，发现与狩猎采集犬相比，瑞典新石器时代农业背景下的一只同期犬更接近中东犬。

三、欧洲狗血统的后期同质化

作者用了homogenization一词描述欧洲各地区品种之间血缘的逐渐趋同。早期欧洲犬中广泛的祖源多样性在今天的欧洲品种中没有得到保留，这表明大多数当地的中石器时代和新石器时代古犬对当今欧洲犬种的多样性几乎没有贡献。相反，作者发现瑞典西南部5千年前Frälsegården遗址的一只新石器时代巨石遗址中的狗可以被建模为大多数现代欧洲品种90%至100%祖先的单一来源代理，这意味着一个祖先与该个体相似但不一定起源于斯堪的纳维亚的种群取代了其他欧洲种群，因此，目前的欧洲狗可以被建模为拥有大约相等比例的Karelia和黎凡特犬相关祖先成分的混合[根据混合图，德国牧羊犬的比例分别为54%和46%]，也就是说，大部分现代欧洲品种虽然外貌上差异巨大但是却都有着非常晚近的共同祖先来源，导致遗传多样性并不高。